活性污泥法是需氧的好氧过程，对于传统活性污泥法，氧的需要出现在污水与污泥开始混合的曝气池首端，常供氧不足，供氧不足会出现厌氧状态，妨碍正常的代谢过程，滋长丝状菌。供氧多少一般用混合液溶解氧的浓度控制。由于活性污泥絮凝体的大小不同，所需要的最小溶解氧浓度也就不一样，絮凝体越小，与污水处理的接触面积越大，也越宜于对氧的摄取，所需要的溶解氧浓度就小；反之絮凝体大，则所需的溶解氧浓度就大，为了使沉淀分离性能良好，较大的絮凝体是所期望的，因此，溶解氧浓度以2mg/L左右为宜。

在污水处理活性污泥系统里，微生物的代谢需要一定比例的营养物，除以BOD表示的碳源外，还需要氮、磷和其他微量元素，生活污水含有微生物所需要的各种元素，但某些工业废水却缺乏一些关键的元素——氮、磷等。对氮、磷的需要量应满足以下比例，即BOD：N：P=100：5：1。

对于好氧生物污水处理，PH值一般以6.5-9.0为宜，PH值低于6.5，真菌即开始与细菌竞争，降低到4.5时，真菌则将完全占优势，严重影响沉淀分离；PH值超过9.0时，代谢速度受到障碍。

对于活性污泥法，其污水处理PH值是指混合液而言，对于碱性废水，生化反应可以起缓冲作用；对于以有机酸为主的酸性废水，生化反应也可起缓冲作用，而且如果在驯化过程中将PH值因素考虑进去，活性污泥也可以逐渐适应，对于出现冲击负荷，PH值急变时，则将给活性污泥以严重打击，净化效果将急剧恶化。在这种情况下，完全混合活性污泥法，则有较大的优越性，为了使污水处理装置稳定运行，应避免PH值急变冲击，酸碱废水在进行生化处理前应进行预处理，将PH调节到适宜范围。

污水处理在微生物酶系统不受变性影响的温度范围内，水温上升就会使微生物活动旺盛，就能够提高反应速度。此外，污水处理水温上升还有利于混合、搅拌、沉淀等物理过程，但不利于氧的转移。

对于生化过程，一般认为水温在20-30℃时效果，35℃以上和10℃以下净化效果即行降低。因此，对高温工业废水要采取降温措施，对寒冷地区的污水处理，则应采取必要的保温措施。目前对于小型生物处理装置，一般采取建在室内的措施加以保温，对于大型污水处理厂，如水温能维持6-7℃，采取提高污泥浓度和降低污泥负荷率等措施，活性污泥仍能有效地发挥其净化功能。

对生物处理有毒害作用的物质很多，毒物大致可分为重金属，H2S等无机物质和氰、酚等有机物质。这些物质对细菌的毒害作用，或是破坏细菌细胞某些必要的生理结构，或是抑制细菌的代谢进程。毒物的毒害作用还与PH值、水温、溶解氧、有无其他毒物及微生物的数量和是否驯化等有很大关系。